Ngày 31 tháng 3 năm 2006, đồng chí Trương Quang Được - Uỷ viên Bộ chính trị, Phó Chủ tịch Quốc hội đã đến làm việc với Lãnh đạo Kiểm toán Nhà nước và trao Nghị quyết của Uỷ ban Thường vụ Quốc hội về việc giao trách nhiệm, quyền hạn Phó Tổng Kiểm toán Nhà nước cho đồng chí Vương Đình Huệ. Theo đó, đồng chí Vương Đình Huệ đảm nhận trách nhiệm, quyền hạn Phó Tổng Kiểm toán Nhà nước theo Điều 20 Luật Kiểm toán Nhà nước và đề nghị của Tổng Kiểm toán Nhà nước kể từ ngày 1/4/2006.
Phát biểu sau khi trao nghị quyết, đồng chí Trương Quang Được cho biết, về bộ máy và tổ chức, đặc biệt là bộ máy cán bộ lãnh đạo các cơ quan trực thuộc Kiểm toán Nhà nước hiện nay đã được Tổng Kiểm toán Nhà nước báo cáo với Uỷ ban Thường vụ Quốc hội xem xét và phê chuẩn theo đúng tinh thần Luật Kiểm toán Nhà nước. Đồng chí Phó Chủ tịch khẳng định rằng bộ máy sẵn có của Kiểm toán Nhà nước hiện nay là vốn quý cần phải được phát huy, Kiểm toán Nhà nước phải làm tốt hơn nữa nhiệm vụ là công cụ giúp việc các cơ quan hoạch định chính sách, giám sát thực thi các chính sách đó. Quốc hội hiện nay đang đặt ra những yêu cầu rất cao trong việc cung cấp tài liệu và ý kiến tư vấn của Kiểm toán Nhà nước.
Biểu dương Kiểm toán Nhà nước đã có nhiều nỗ lực trong việc triển khai thi hành Luật, kịp thời chuẩn bị và trình Quốc hội xem xét, phê chuẩn các nghị quyết hướng dẫn thi hành Luật, kể cả những nội dung phức tạp như kiểm toán hoạt động an ninh, quốc phòng; đồng chí Trương Quang Được khẳng định tất cả mọi lĩnh vực liên quan đến quản lý và sử dụng ngân sách nhà nước đều phải được kiểm tra, kiểm toán, Kiểm toán Nhà nước phải phấn đấu nỗ lực để hoạt động phát huy được hiệu lực, hiệu quả ngay từ năm đầu triển khai thi hành Luật.